EPPO-Q-bank

A database to support plant pest diagnostic activities

Bacteria - Organisms included (140)


EPPO Code Preferred Name EPPO Categorization Nb Strains Nb Sequences
BRNNGO Brenneria goodwinii 1 1
ERWINI Brenneria nigrifluens 1 1
BRNNRA Brenneria roseae subsp. americana 1 1
BRNNRR Brenneria roseae subsp. roseae 1 1
ERWIRU Brenneria rubrifaciens 1 1
ERWISA Brenneria salicis 1 1
CELLBI Cellulomonas biazotea 1 2
CELLFI Cellulomonas fimi 1 2
CORBIN Clavibacter insidiosus A2 list 6 12
Z00003 Clavibacter look-alike 1 2
CORBMI Clavibacter michiganensis A2 list 18 36
CORBNE Clavibacter nebraskensis 4 8
CORBSE Clavibacter sepedonicus A2 list 20 40
CLABMT Clavibacter tessellarius 4 8
CURTCI Curtobacterium citreum 1 2
CURTLU Curtobacterium luteum 1 2
ERWIAM Erwinia amylovora A2 list 11 27
ERWIAP Erwinia aphidicola 1 2
ERWIBI Erwinia billingiae 1 2
ERWIEN Erwinia endophytica 1 2
ERWIGE Erwinia gerundensis 1 2
ERWIMA Erwinia mallotivora 1 2
ERWIOL Erwinia oleae 1 2
ERWIPA Erwinia papayae 1 2
ERWIPE Erwinia persicina 1 2
ERWIPI Erwinia piriflorinigrans 1 2
ERWIPS Erwinia psidii 1 2
ERWIPY Erwinia pyrifoliae Alert list (formerly) 2 4
ERWIRH Erwinia rhapontici 2 3
ERWITA Erwinia tasmaniensis 1 2
ERWITR Erwinia tracheiphila 1 2
ERWITY Erwinia typographi 1 1
ERWIUZ Erwinia uzenensis 1 2
LEIFAQ Leifsonia aquatica 2 4
LEIFKA Leifsonia kafniensis 1 2
LNSDQI Lonsdalea iberica 1 1
LNSDQP Lonsdalea populi 1 1
ERWIQU Lonsdalea quercina Alert list (formerly) 1 1
MCRBFO Microbacterium foliorum 1 2
MCRBPH Microbacterium phyllosphaerae 1 2
MCTRPI Microterricola pindariensis 1 2
OERSTU Oerskovia turbata 1 2
PSDMMP Pseudomonas syringae pv. morsprunorum 1 2
RALSMA Ralstonia mannitolilytica 1 1
RALSPI Ralstonia pickettii 2 2
RALSPS Ralstonia pseudosolanacearum A2 list 35 39
RALSSL Ralstonia solanacearum A2 list 26 26
RALSSO Ralstonia solanacearum species complex A2 list 3 3
RALSSY Ralstonia syzygii A1 list 1 1
RALSSC Ralstonia syzygii subsp. celebesensis 1 1
RALSSI Ralstonia syzygii subsp. indonesiensis 3 3
RALSSS Ralstonia syzygii subsp. syzygii 2 2
CORBIR Rathayibacter iranicus 1 2
CORBRA Rathayibacter rathayi 3 6
CORBTR Rathayibacter tritici 1 2
WINSIN Winslowiella iniecta 1 1
WINSTO Winslowiella toletana 1 2
XANTAB Xanthomonas albilineans 1 2
XANTBE Xanthomonas axonopodis pv. begoniae 1 3
XANTAE Xanthomonas axonopodis pv. betlicola 1 3
XANTAY Xanthomonas axonopodis pv. cyamopsidis 1 3
XANTAD Xanthomonas axonopodis pv. desmodiigangetici 1 3
XANTNA Xanthomonas axonopodis pv. nakataecorchori 1 3
XANTPA Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae 1 2
XANTCN Xanthomonas campestris pv. cannabis 1 2
XANTCL Xanthomonas campestris pv. esculenti 1 2
XANTGU Xanthomonas campestris pv. gummisudans 1 2
XANTIO Xanthomonas campestris pv. ionidii 1 2
XANTLW Xanthomonas campestris pv. lawsoniae 1 3
XANTLE Xanthomonas campestris pv. leeana 1 3
XANTCQ Xanthomonas campestris pv. phormiicola 1 2
XANTCF Xanthomonas campestris pv. vitistrifoliae 1 3
XANTZN Xanthomonas campestris pv. zinniae 1 2
XANTAZ Xanthomonas citri pv. aracearum 2 6
XANTAU Xanthomonas citri pv. aurantifolii A1 list 6 18
XANTCJ Xanthomonas citri pv. cajani 1 3
XANTCI Xanthomonas citri pv. citri A1 list 25 75
XANTCW Xanthomonas citri pv. clitoriae 1 3
XANTFF Xanthomonas citri pv. fuscans A2 list 16 48
XANTGL Xanthomonas citri pv. glycines 3 7
XANTMA Xanthomonas citri pv. malvacearum 1 3
XANTMI Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae 3 9
XANTIR Xanthomonas citri pv. rhynchosiae 2 6
XANTCX Xanthomonas citri pv. sesbaniae 1 3
XANTTM Xanthomonas citri pv. thirumalacharii 1 3
XANTCG Xanthomonas citri pv. vignaeradiatae 1 3
XANTVG Xanthomonas citri pv. vignicola 1 3
XANTCV Xanthomonas citri pv. viticola 1 3
XANTKO Xanthomonas codiaei 1 2
XANTCU Xanthomonas cucurbitae 1 2
XANTDE Xanthomonas dyei pv. eucalypti 1 2
XANTDL Xanthomonas dyei pv. laureliae 1 2
XANTEA Xanthomonas euvesicatoria pv. alangii 2 6
XANTAL Xanthomonas euvesicatoria pv. alfalfae 2 6
XANTAA Xanthomonas euvesicatoria pv. allii A1 list 10 30
XANTER Xanthomonas euvesicatoria pv. argemones 1 3
XANTEB Xanthomonas euvesicatoria pv. betae 1 3
XANTCM Xanthomonas euvesicatoria pv. citrumelonis A1/A2 (formerly) 2 6
XANTCC Xanthomonas euvesicatoria pv. coracanae 1 3
XANTAH Xanthomonas euvesicatoria pv. erythrinae 1 3
XANTEU Xanthomonas euvesicatoria pv. euvesicatoria A2 list 7 21
XANTPF Xanthomonas euvesicatoria pv. perforans A2 list 1 3
XANTEP Xanthomonas euvesicatoria pv. physalidis 1 3
XANTET Xanthomonas euvesicatoria pv. tribuli 1 3
XANTFR Xanthomonas fragariae A2 list 6 13
XANTSY Xanthomonas hortorum pv. cynarae 1 2
XANTGA Xanthomonas hortorum pv. gardneri A2 list 3 9
XANTHE Xanthomonas hortorum pv. hederae 1 2
XANTHY Xanthomonas hyacinthi A1/A2 (formerly) 1 2
XANTME Xanthomonas melonis 1 2
XANTOL Xanthomonas oryzae pv. leersiae 1 3
XANTOR Xanthomonas oryzae pv. oryzae A1 list 15 32
XANTTO Xanthomonas oryzae pv. oryzicola A1 list 6 12
XANTPD Xanthomonas phaseoli pv. dieffenbachiae A2 list 6 18
XANTMN Xanthomonas phaseoli pv. manihotis 1 3
XANTPH Xanthomonas phaseoli pv. phaseoli A2 list 9 27
XANTPS Xanthomonas phaseoli pv. syngonii 1 3
XANTPI Xanthomonas pisi 1 2
XANTPO Xanthomonas populi A1/A2 (formerly) 1 2
XANTSA Xanthomonas sacchari 1 2
XANTSP Xanthomonas sp. 4 8
XANTTH Xanthomonas theicola 1 2
XANTAT Xanthomonas translucens pv. arrhenatheri 1 2
XANTCE Xanthomonas translucens pv. cerealis 4 8
XANTGR Xanthomonas translucens pv. graminis 1 2
XANTPL Xanthomonas translucens pv. phlei 2 4
XANTTP Xanthomonas translucens pv. phleipratensis 1 2
XANTCP Xanthomonas translucens pv. poae 1 2
XANTSC Xanthomonas translucens pv. secalis 1 3
XANTTR Xanthomonas translucens pv. translucens A2 list 6 14
XANTTU Xanthomonas translucens pv. undulosa 2 4
XANTHO Xanthomonas vasicola pv. holcicola 2 5
XANTVV Xanthomonas vasicola pv. vasculorum 1 2
XANTVE Xanthomonas vesicatoria A2 list 5 15
XYLEFF Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa 12 89
XYLEFO Xylella fastidiosa subsp. morus 2 9
XYLEFM Xylella fastidiosa subsp. multiplex 8 67
XYLEFP Xylella fastidiosa subsp. pauca 8 58
XYLEFS Xylella fastidiosa subsp. sandyi 2 17
XYLETA Xylella taiwanensis 1 7